TRPC4AP

TRPC4AP
Ідентифікатори
Символи	TRPC4AP, C20orf188, PPP1R158, TRRP4AP, TRUSS, transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein
Зовнішні ІД	OMIM: 608430 MGI: 1930751 HomoloGene: 9224 GeneCards: TRPC4AP
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium channel activity Клітинна компонента • клітинна мембрана • Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex Біологічний процес • calcium ion transmembrane transport • Убіквітин-залежний протеоліз • hair follicle maturation • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26133	56407
Ensembl	ENSG00000100991	ENSMUSG00000038324
UniProt	Q8TEL6	Q9JLV2
RefSeq (мРНК)	NM_015638 NM_199368	NM_001163452 NM_019828
RefSeq (білок)	NP_056453 NP_955400	NP_001156924 NP_062802
Локус (UCSC)	Хр. 20: 35 – 35.09 Mb	Хр. 2: 155.48 – 155.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRPC4AP (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 797 амінокислот, а молекулярна маса — 90 852.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAPVAAGS		GAGRGRRSAA		TVAAWGGWGG		RPRPGNILLQ		LRQGQLTGRG
LVRAVQFTET		FLTERDKQSK		WSGIPQLLLK		LHTTSHLHSD		FVECQNILKE
ISPLLSMEAM		AFVTEERKLT		QETTYPNTYI		FDLFGGVDLL		VEILMRPTIS
IRGQKLKISD		EMSKDCLSIL		YNTCVCTEGV		TKRLAEKNDF		VIFLFTLMTS
KKTFLQTATL		IEDILGVKKE		MIRLDEVPNL		SSLVSNFDQQ		QLANFCRILA
VTISEMDTGN		DDKHTLLAKN		AQQKKSLSLG		PSAAEINQAA		LLSIPGFVER
LCKLATRKVS		ESTGTASFLQ		ELEEWYTWLD		NALVLDALMR		VANEESEHNQ
ASIVFPPPGA		SEENGLPHTS		ARTQLPQSMK		IMHEIMYKLE		VLYVLCVLLM
GRQRNQVHRM		IAEFKLIPGL		NNLFDKLIWR		KHSASALVLH		GHNQNCDCSP
DITLKIQFLR		LLQSFSDHHE		NKYLLLNNQE		LNELSAISLK		ANIPEVEAVL
NTDRSLVCDG		KRGLLTRLLQ		VMKKEPAESS		FRFWQARAVE		SFLRGTTSYA
DQMFLLKRGL		LEHILYCIVD		SECKSRDVLQ		SYFDLLGELM		KFNVDAFKRF
NKYINTDAKF		QVFLKQINSS		LVDSNMLVRC		VTLSLDRFEN		QVDMKVAEVL
SECRLLAYIS		QVPTQMSFLF		RLINIIHVQT		LTQENVSCLN		TSLVILMLAR
RKERLPLYLR		LLQRMEHSKK		YPGFLLNNFH		NLLRFWQQHY		LHKDKDSTCL
ENSSCISFSY		WKETVSILLN		PDRQSPSALV		SYIEEPYMDI		DRDFTEE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Choi S.H., Wright J.B., Gerber S.A., Cole M.D. (2010). Myc protein is stabilized by suppression of a novel E3 ligase complex in cancer cells. Genes Dev. 24: 1236—1241. PMID 20551172 doi:10.1101/gad.1920310
• Li T., Robert E.I., van Breugel P.C., Strubin M., Zheng N. (2010). A promiscuous alpha-helical motif anchors viral hijackers and substrate receptors to the CUL4-DDB1 ubiquitin ligase machinery. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 105—111. PMID 19966799 doi:10.1038/nsmb.1719

Див. також

• Хромосома 20