PIWIL1

PIWIL1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2L5C, 2L5D, 3O3I, 3O6E, 3O7V
Ідентифікатори
Символи	PIWIL1, CT80.1, HIWI, MIWI, PIWI, piwi like RNA-mediated gene silencing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605571 MGI: 1928897 HomoloGene: 37963 GeneCards: PIWIL1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein kinase binding • RNA binding • single-stranded RNA binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • nuclease activity • endonuclease activity • endoribonuclease activity • hydrolase activity • зв’язування з іоном металу • piRNA binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • polysome binding • mRNA cap binding complex binding Клітинна компонента • Полісома • клітинне ядро • mRNA cap binding complex • dense body • P granule • цитоплазма • chromatoid body Біологічний процес • multicellular organism development • regulation of translation • GO:0007126 мейоз • диференціація клітин • Сайленсинг генів • Сперматогенез • negative regulation of transposition • piRNA metabolic process • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • spermatid development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9271	57749
Ensembl	ENSG00000275051 ENSG00000125207	ENSMUSG00000029423
UniProt	Q96J94	Q9JMB7
RefSeq (мРНК)	NM_001190971 NM_004764	NM_021311
RefSeq (білок)	NP_001177900 NP_004755	NP_067286
Локус (UCSC)	Хр. 12: 130.34 – 130.37 Mb	Хр. 5: 128.78 – 128.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PIWIL1 (англ. Piwi like RNA-mediated gene silencing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 861 амінокислот, а молекулярна маса — 98 603.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTGRARARAR		GRARGQETAQ		LVGSTASQQP		GYIQPRPQPP		PAEGELFGRG
RQRGTAGGTA		KSQGLQISAG		FQELSLAERG		GRRRDFHDLG		VNTRQNLDHV
KESKTGSSGI		IVRLSTNHFR		LTSRPQWALY		QYHIDYNPLM		EARRLRSALL
FQHEDLIGKC		HAFDGTILFL		PKRLQQKVTE		VFSKTRNGED		VRITITLTNE
LPPTSPTCLQ		FYNIIFRRLL		KIMNLQQIGR		NYYNPNDPID		IPSHRLVIWP
GFTTSILQYE		NSIMLCTDVS		HKVLRSETVL		DFMFNFYHQT		EEHKFQEQVS
KELIGLVVLT		KYNNKTYRVD		DIDWDQNPKS		TFKKADGSEV		SFLEYYRKQY
NQEITDLKQP		VLVSQPKRRR		GPGGTLPGPA		MLIPELCYLT		GLTDKMRNDF
NVMKDLAVHT		RLTPEQRQRE		VGRLIDYIHK		NDNVQRELRD		WGLSFDSNLL
SFSGRILQTE		KIHQGGKTFD		YNPQFADWSK		ETRGAPLISV		KPLDNWLLIY
TRRNYEAANS		LIQNLFKVTP		AMGMQMRKAI		MIEVDDRTEA		YLRVLQQKVT
ADTQIVVCLL		SSNRKDKYDA		IKKYLCTDCP		TPSQCVVART		LGKQQTVMAI
ATKIALQMNC		KMGGELWRVD		IPLKLVMIVG		IDCYHDMTAG		RRSIAGFVAS
INEGMTRWFS		RCIFQDRGQE		LVDGLKVCLQ		AALRAWNSCN		EYMPSRIIVY
RDGVGDGQLK		TLVNYEVPQF		LDCLKSIGRG		YNPRLTVIVV		KKRVNTRFFA
QSGGRLQNPL		PGTVIDVEVT		RPEWYDFFIV		SQAVRSGSVS		PTHYNVIYDN
SGLKPDHIQR		LTYKLCHIYY		NWPGVIRVPA		PCQYAHKLAF		LVGQSIHREP
NLSLSNRLYY		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, білків розвитку, ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, диференціація клітин, сперматогенез, РНК-залежне заглушення генів, мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Qiao D., Zeeman A.-M., Deng W., Looijenga L.H.J., Lin H. (2002). Molecular characterization of hiwi, a human member of the piwi gene family whose overexpression is correlated to seminomas. Oncogene. 21: 3988—3999. PMID 12037681 doi:10.1038/sj.onc.1205505
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Sasaki T., Shiohama A., Minoshima S., Shimizu N. (2003). Identification of eight members of the Argonaute family in the human genome. Genomics. 82: 323—330. PMID 12906857 doi:10.1016/S0888-7543(03)00129-0
• Tian Y., Simanshu D.K., Ma J.B., Patel D.J. (2011). Structural basis for piRNA 2'-O-methylated 3'-end recognition by Piwi PAZ (Piwi/Argonaute/Zwille) domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 903—910. PMID 21193640 doi:10.1073/pnas.1017762108
• Zeng L., Zhang Q., Yan K., Zhou M.M. (2011). Structural insights into piRNA recognition by the human PIWI-like 1 PAZ domain. Proteins. 79: 2004—2009. PMID 21465557 doi:10.1002/prot.23003

Див. також

• Хромосома 12