Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
					 
					
MESP2
  
Ідентифікатори
 Символи  
MESP2  , SCDO2, bHLHc6, mesoderm posterior bHLH transcription factor 2 
Зовнішні ІД 
OMIM : 605195  MGI:  1096325  HomoloGene:  7420  GeneCards:  MESP2   
Онтологія гена  
Молекулярна функція 
•  DNA binding •  protein dimerization activity •  GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •  GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific •  GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •  GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity  
 Клітинна компонента 
•  клітинне ядро  
 Біологічний процес 
•  Сигнальний шлях Notch •  multicellular organism development •  GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •  transcription, DNA-templated •  mesoderm formation •  somitogenesis •  heart morphogenesis •  transcription by RNA polymerase II •  embryonic pattern specification •  GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •  GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II  
 Джерела:Amigo  / QuickGO  
 Ортологи 
Види 
Людина  
Миша  
Entrez  
 
Ensembl  
 
 
UniProt  
 
 
RefSeq (мРНК) 
RefSeq (білок) 
Локус (UCSC) 
Хр. 15: 89.76 – 89.78 Mb  
Хр. 7: 79.46 – 79.46 Mb  
PubMed  search 
[ 1]  
[ 2] Вікідані 
MESP2  (англ.  Mesoderm posterior bHLH transcription factor 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[ 3]   Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот , а молекулярна маса  — 41 760[ 4]  .
Послідовність амінокислот
10
 
 
20
 
 
30
 
 
40
 
 
50
  
MAQSPPPQSL
 
 
LGHDHWIFAQ
 
 
GWGWAGHWDS
 
 
TSPASSSDSS
 
 
GSCPCDGARG
  
LPQPQPPSCS
 
 
SRAAEAAATT
 
 
PRRARTGPAG
 
 
GQRQSASERE
 
 
KLRMRTLARA
  
LHELRRFLPP
 
 
SLAPAGQSLT
 
 
KIETLRLAIR
 
 
YIGHLSAVLG
 
 
LSEESLQCRR
  
RQRGDAGSPW
 
 
GCPLCPDRGP
 
 
AEAQTQAEGQ
 
 
GQGQGQGQGQ
 
 
GQGQGQGQGQ
  
GQGQGRRPGL
 
 
VSAVLAEASW
 
 
GSPSACPGAQ
 
 
AAPERLGRGV
 
 
HDTDPWATPP
  
YCPKIQSPPY
 
 
SSQGTTSDAS
 
 
LWTPPQGCPW
 
 
TQSSPEPRNP
 
 
PVPWTAAPAT
  
LELAAVYQGL
 
 
SVSPEPCLSL
 
 
GAPSLLPHPS
 
 
CQRLQPQTPG
 
 
RCWSHSAEVV
  
PNSEDQGPGA
 
 
AFQLSEASPP
 
 
QSSGLRFSGC
 
 
PELWQEDLEG
 
 
ARLGIFY
  
  
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку . 
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції . 
Білок має сайт для зв'язування з ДНК . 
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004.   PMID  15489334  doi :10.1101/gr.2596504  
McLellan A.S., Langlands K., Kealey T. (2002). Exhaustive identification of human class II basic helix-loop-helix proteins by virtual library screening. Mech. Dev . 119 : S285—S291.   PMID  14516699  doi :10.1016/S0925-4773(03)00130-8  
 
(1) Основні домени 
(1.1) Лейцинова застібка   (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль  (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль  / Лейцинова застібка  (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль  (bHSH)
(2)  Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 ) 
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0 
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4  (2.3) Cys2 His2   з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6   цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль 
(3.1)  Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3)  Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4)  Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом 
(4.1)  RHR(4.2)  STAT(4.3) p53 (4.4)  MADS(4.6)  TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt 
 (0) Інші фактори транскрипції 
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5)  AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші