CSF2RA

CSF2RA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4NKQ, 4RS1
Ідентифікатори
Символи	CSF2RA, CD116, CDw116, CSF2R, CSF2RAX, CSF2RAY, CSF2RX, CSF2RY, GM-CSF-R-alpha, GMCSFR, GMR, SMDP4, colony stimulating factor 2 receptor alpha subunit, alphaGMR, colony stimulating factor 2 receptor subunit alpha, GMR-alpha, GMCSFR-alpha, granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 425000, 306250 MGI: 1339754 HomoloGene: 48406 GeneCards: CSF2RA
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0016518 cytokine receptor activity • protein tyrosine kinase activity • signaling receptor activity • GO:0019974 cytokine binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • внутрішньоклітинний • external side of plasma membrane • receptor complex Біологічний процес • MAPK cascade • peptidyl-tyrosine phosphorylation • cytokine-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1438	12982
Ensembl	ENSG00000198223	ENSMUSG00000059326
UniProt	P15509	Q00941
RefSeq (мРНК)	NM_001161529 NM_001161530 NM_001161531 NM_001161532 NM_006140 NM_172245 NM_172246 NM_172247 NM_172248 NM_172249 NM_001379153 NM_001379154 NM_001379155 NM_001379156 NM_001379158 NM_001379159 NM_001379160 NM_001379161 NM_001379162 NM_001379163 NM_001379164 NM_001379165 NM_001379166 NM_001379167 NM_001379168 NM_001379169	NM_009970
RefSeq (білок)	NP_001155001 NP_001155002 NP_001155003 NP_001155004 NP_006131 NP_758448 NP_758449 NP_758450 NP_758452 NP_001366082 NP_001366083 NP_001366084 NP_001366085 NP_001366087 NP_001366088 NP_001366089 NP_001366090 NP_001366091 NP_001366092 NP_001366093 NP_001366094 NP_001366095 NP_001366096 NP_001366097 NP_001366098	NP_034100
Локус (UCSC)	Хр. X: 1.27 – 1.31 Mb	Хр. 19: 61.22 – 61.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CSF2RA (англ. Colony stimulating factor 2 receptor alpha subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 400 амінокислот, а молекулярна маса — 46 207.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLLVTSLLL		CELPHPAFLL		IPEKSDLRTV		APASSLNVRF		DSRTMNLSWD
CQENTTFSKC		FLTDKKNRVV		EPRLSNNECS		CTFREICLHE		GVTFEVHVNT
SQRGFQQKLL		YPNSGREGTA		AQNFSCFIYN		ADLMNCTWAR		GPTAPRDVQY
FLYIRNSKRR		REIRCPYYIQ		DSGTHVGCHL		DNLSGLTSRN		YFLVNGTSRE
IGIQFFDSLL		DTKKIERFNP		PSNVTVRCNT		THCLVRWKQP		RTYQKLSYLD
FQYQLDVHRK		NTQPGTENLL		INVSGDLENR		YNFPSSEPRA		KHSVKIRAAD
VRILNWSSWS		EAIEFGSDDG		NLGSVYIYVL		LIVGTLVCGI		VLGFLFKRFL
RIQRLFPPVP		QIKDKLNDNH		EVEDEIIWEE		FTPEEGKGYR		EEVLTVKEIT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Crosier K.E., Wong G.G., Mathey-Prevot B., Nathan D.G., Sieff C.A. (1991). A functional isoform of the human granulocyte/macrophage colony-stimulating factor receptor has an unusual cytoplasmic domain. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 7744—7748. PMID 1715577 doi:10.1073/pnas.88.17.7744
• Ashworth A., Kraft A. (1990). Cloning of a potentially soluble receptor for human GM-CSF. Nucleic Acids Res. 18: 7178—7178. PMID 2148207 doi:10.1093/nar/18.23.7178
• Hu X., Emanuel P.D., Zuckerman K.S. (1994). Cloning and sequencing of the cDNAs encoding two alternative splicing-derived variants of the alpha subunit of the granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor. Biochim. Biophys. Acta. 1223: 306—308. PMID 8086503 doi:10.1016/0167-4889(94)90241-0
• Pelley J.L., Nicholls C.D., Beattie T.L., Brown C.B. (2007). Discovery and characterization of a novel splice variant of the GM-CSF receptor alpha subunit. Exp. Hematol. 35: 1483—1494. PMID 17681666 doi:10.1016/j.exphem.2007.06.008
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Rappold G., Willson T.A., Henke A., Gough N.M. (1992). Arrangement and localization of the human GM-CSF receptor alpha chain gene CSF2RA within the X-Y pseudoautosomal region. Genomics. 14: 455—461. PMID 1358805 doi:10.1016/S0888-7543(05)80241-1

Див. також

• Хромосома X