COL8A2

COL8A2
Ідентифікатори
Символи	COL8A2, FECD, FECD1, PPCD, PPCD2, collagen type VIII alpha 2, collagen type VIII alpha 2 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 120252 MGI: 88464 HomoloGene: 55879 GeneCards: COL8A2
Пов'язані генетичні захворювання
	Fuchs' endothelial dystrophy
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein-macromolecule adaptor activity; • extracellular matrix structural constituent; • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця; • extracellular region; • базальна мембрана; • колаген; • endoplasmic reticulum lumen; • міжклітинний простір; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• collagen catabolic process; • extracellular matrix organization; • epithelial cell proliferation; • адгезія клітин; • camera-type eye morphogenesis; • Ангіогенез; • cell-cell adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	1296
	329941
	ENSG00000171812
	ENSMUSG00000056174
	P25067; Q4VAQ0
	P25318
	NM_001294347; NM_005202
	NM_199473
	NP_001281276; NP_005193
	NP_955767
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COL8A2 (англ. Collagen type VIII alpha 2 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 703 амінокислот, а молекулярна маса — 67 244^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLGTLTPLSS	LLLLLLVLVL	GCGPRASSGG	GAGGAAGYAP	VKYIQPMQKG
PVGPPFREGK	GQYLEMPLPL	LPMDLKGEPG	PPGKPGPRGP	PGPPGFPGKP
GMGKPGLHGQ	PGPAGPPGFS	RMGKAGPPGL	PGKVGPPGQP	GLRGEPGIRG
DQGLRGPPGP	PGLPGPSGIT	IPGKPGAQGV	PGPPGFQGEP	GPQGEPGPPG
DRGLKGDNGV	GQPGLPGAPG	QGGAPGPPGL	PGPAGLGKPG	LDGLPGAPGD
KGESGPPGVP	GPRGEPGAVG	PKGPPGVDGV	GVPGAAGLPG	PQGPSGAKGE
PGTRGPPGLI	GPTGYGMPGL	PGPKGDRGPA	GVPGLLGDRG	EPGEDGEPGE
QGPQGLGGPP	GLPGSAGLPG	RRGPPGPKGE	AGPGGPPGVP	GIRGDQGPSG
LAGKPGVPGE	RGLPGAHGPP	GPTGPKGEPG	FTGRPGGPGV	AGALGQKGDL
GLPGQPGLRG	PSGIPGLQGP	AGPIGPQGLP	GLKGEPGLPG	PPGEGRAGEP
GTAGPTGPPG	VPGSPGITGP	PGPPGPPGPP	GAPGAFDETG	IAGLHLPNGG
VEGAVLGKGG	KPQFGLGELS	AHATPAFTAV	LTSPFPASGM	PVKFDRTLYN
GHSGYNPATG	IFTCPVGGVY	YFAYHVHVKG	TNVWVALYKN	NVPATYTYDE
YKKGYLDQAS	GGAVLQLRPN	DQVWVQMPSD	QANGLYSTEY	IHSSFSGFLL
CPT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, ангіогенез, поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

Kittelberger R., Neale T.J., Francky K.T., Greenhill N.S., Gibson G.J. (1992). Cleavage of type VIII collagen by human neutrophil elastase. Biochim. Biophys. Acta. 1139: 295—299. PMID 1515454 doi:10.1016/0925-4439(92)90103-T
Greenhill N.S., Ruger B.M., Hasan Q., Davis P.F. (2000). The alpha1(VIII) and alpha2(VIII) collagen chains form two distinct homotrimeric proteins in vivo. Matrix Biol. 19: 19—28. PMID 10686422 doi:10.1016/S0945-053X(99)00053-0
Stephan S., Sherratt M.J., Hodson N., Shuttleworth C.A., Kielty C.M. (2004). Expression and supramolecular assembly of recombinant alpha1(viii) and alpha2(viii) collagen homotrimers. J. Biol. Chem. 279: 21469—21477. PMID 14990571 doi:10.1074/jbc.M305805200