CLSPN

CLSPN
Ідентифікатори
Символи	CLSPN, claspin
Зовнішні ІД	OMIM: 605434 MGI: 2445153 HomoloGene: 11138 GeneCards: CLSPN
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • anaphase-promoting complex binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі Біологічний процес • реплікація ДНК • клітинний цикл • DNA damage checkpoint signaling • mitotic DNA replication checkpoint signaling • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation • activation of protein kinase activity • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0100026 Репарація ДНК • protein deubiquitination • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	63967	269582
Ensembl	ENSG00000092853	ENSMUSG00000042489
UniProt	Q9HAW4	Q80YR7
RefSeq (мРНК)	NM_001190481 NM_022111 NM_001330490	NM_175554
RefSeq (білок)	NP_001177410 NP_001317419 NP_071394	NP_780763 NP_001392727 NP_001392728 NP_001392729 NP_001392730
Локус (UCSC)	Хр. 1: 35.72 – 35.77 Mb	Хр. 4: 126.45 – 126.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLSPN (англ. Claspin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 339 амінокислот, а молекулярна маса — 151 094.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTGEVGSEVH		LEINDPNVIS		QEEADSPSDS		GQGSYETIGP		LSEGDSDEEI
FVSKKLKNRK		VLQDSDSETE		DTNASPEKTT		YDSAEEENKE		NLYAGKNTKI
KRIYKTVADS		DESYMEKSLY		QENLEAQVKP		CLELSLQSGN		STDFTTDRKS
SKKHIHDKEG		TAGKAKVKSK		RRLEKEERKM		EKIRQLKKKE		TKNQEDDVEQ
PFNDSGCLLV		DKDLFETGLE		DENNSPLEDE		ESLESIRAAV		KNKVKKHKKK
EPSLESGVHS		FEEGSELSKG		TTRKERKAAR		LSKEALKQLH		SETQRLIRES
ALNLPYHMPE		NKTIHDFFKR		KPRPTCHGNA		MALLKSSKYQ		SSHHKEIIDT
ANTTEMNSDH		HSKGSEQTTG		AENEVETNAL		PVVSKETQII		TGSDESCRKD
LVKNEELEIQ		EKQKQSDIRP		SPGDSSVLQQ		ESNFLGNNHS		EECQVGGLVA
FEPHALEGEG		PQNPEETDEK		VEEPEQQNKS		SAVGPPEKVR		RFTLDRLKQL
GVDVSIKPRL		GADEDSFVIL		EPETNRELEA		LKQRFWKHAN		PAAKPRAGQT
VNVNVIVKDM		GTDGKEELKA		DVVPVTLAPK		KLDGASHTKP		GEKLQVLKAK
LQEAMKLRRF		EERQKRQALF		KLDNEDGFEE		EEEEEEEMTD		ESEEDGEEKV
EKEEKEEELE		EEEEKEEEEE		EEGNQETAEF		LLSSEEIETK		DEKEMDKENN
DGSSEIGKAV		GFLSVPKSLS		SDSTLLLFKD		SSSKMGYFPT		EEKSETDENS
GKQPSKLDED		DSCSLLTKES		SHNSSFELIG		STIPSYQPCN		RQTGRGTSFF
PTAGGFRSPS		PGLFRASLVS		SASKSSGKLS		EPSLPIEDSQ		DLYNASPEPK
TLFLGAGDFQ		FCLEDDTQSQ		LLDADGFLNV		RNHRNQYQAL		KPRLPLASMD
ENAMDANMDE		LLDLCTGKFT		SQAEKHLPRK		SDKKENMEEL		LNLCSGKFTS
QDASTPASSE		LNKQEKESSM		GDPMEEALAL		CSGSFPTDKE		EEDEEEEFGD
FRLVSNDNEF		DSDEDEHSDS		GNDLALEDHE		DDDEEELLKR		SEKLKRQMRL
RKYLEDEAEV		SGSDVGSEDE		YDGEEIDEYE		EDVIDEVLPS		DEELQSQIKK
IHMKTMLDDD		KRQLRLYQER		YLADGDLHSD		GPGRMRKFRW		KNIDDASQMD
LFHRDSDDDQ		TEEQLDESEA		RWRKERIERE		QWLRDMAQQG		KITAEEEEEI
GEDSQFMILA		KKVTAKALQK		NASRPMVIQE		SKSLLRNPFE		AIRPGSAQQV
KTGSLLNQPK		AVLQKLAALS		DHNPSAPRNS		RNFVFHTLSP		VKAEAAKESS
KSQVKKRGPS		FMTSPSPKHL		KTDDSTSGLT		RSIFKYLES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Kumagai A., Dunphy W.G. (2000). Claspin, a novel protein required for the activation of Chk1 during a DNA replication checkpoint response in Xenopus egg extracts. Mol. Cell. 6: 839—849. PMID 11090622 doi:10.1016/S1097-2765(05)00092-4
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Chini C.C.S., Chen J. (2003). Human claspin is required for replication checkpoint control. J. Biol. Chem. 278: 30057—30062. PMID 12766152 doi:10.1074/jbc.M301136200
• Lin S.-Y., Li K., Stewart G.S., Elledge S.J. (2004). Human claspin works with BRCA1 to both positively and negatively regulate cell proliferation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 6484—6489. PMID 15096610 doi:10.1073/pnas.0401847101
• Clarke C.A.L., Clarke P.R. (2005). DNA-dependent phosphorylation of Chk1 and claspin in a human cell-free system. Biochem. J. 388: 705—712. PMID 15707391 doi:10.1042/BJ20041966
• Zhang D., Zaugg K., Mak T.W., Elledge S.J. (2006). A role for the deubiquitinating enzyme USP28 in control of the DNA-damage response. Cell. 126: 529—542. PMID 16901786 doi:10.1016/j.cell.2006.06.039

Див. також

• Хромосома 1