CHMP4B

CHMP4B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3C3Q, 3UM3, 4ABM
Ідентифікатори
Символи	CHMP4B, C20orf178, CHMP4A, CTPP3, CTRCT31, SNF7, SNF7-2, Shax1, VPS32B, Vps32-2, dJ553F4.4, charged multivesicular body protein 4B
Зовнішні ІД	OMIM: 610897 MGI: 1922858 HomoloGene: 57102 GeneCards: CHMP4B
Пов'язані генетичні захворювання
	cataract 31 multiple types
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • cadherin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ESCRT III complex; • гіалоплазма; • ендосома; • мембрана; • late endosome membrane; • cytoplasmic side of plasma membrane; • membrane coat; • екзосома; • везикула; • midbody; • nuclear envelope; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• negative regulation of autophagosome assembly; • regulation of centrosome duplication; • GO:0019067 viral life cycle; • nucleus organization; • maintenance of lens transparency; • multivesicular body assembly; • negative regulation of cell death; • regulation of mitotic spindle assembly; • автофагія; • endosomal transport; • posttranslational protein targeting to endoplasmic reticulum membrane; • ubiquitin-independent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway; • protein transport; • septum digestion after cytokinesis; • mitotic metaphase plate congression; • protein homooligomerization; • vacuolar transport; • negative regulation of neuron death; • nuclear membrane reassembly; • exit from mitosis; • mitotic cytokinesis; • regulation of autophagy; • membrane fission; • macroautophagy; • GO:0015915 транспорт; • viral budding via host ESCRT complex; • midbody abscission;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	128866
	75608
	ENSG00000101421
	ENSMUSG00000038467
	Q9H444
	Q9D8B3
	NM_176812
	NM_029362
	NP_789782
	NP_083638
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CHMP4B (англ. Charged multivesicular body protein 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 224 амінокислот, а молекулярна маса — 24 950^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSVFGKLFGA	GGGKAGKGGP	TPQEAIQRLR	DTEEMLSKKQ	EFLEKKIEQE
LTAAKKHGTK	NKRAALQALK	RKKRYEKQLA	QIDGTLSTIE	FQREALENAN
TNTEVLKNMG	YAAKAMKAAH	DNMDIDKVDE	LMQDIADQQE	LAEEISTAIS
KPVGFGEEFD	EDELMAELEE	LEQEELDKNL	LEISGPETVP	LPNVPSIALP
SKPAKKKEEE	DDDMKELENW	AGSM

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендосомах.

Література

Peck J.W., Bowden E.T., Burbelo P.D. (2004). Structure and function of human Vps20 and Snf7 proteins. Biochem. J. 377: 693—700. PMID 14583093 doi:10.1042/BJ20031347
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Strack B., Calistri A., Craig S., Popova E., Goettlinger H.G. (2003). AIP1/ALIX is a binding partner for HIV-1 p6 and EIAV p9 functioning in virus budding. Cell. 114: 689—699. PMID 14505569 doi:10.1016/S0092-8674(03)00653-6
Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 doi:10.1073/pnas.2133846100
Katoh K., Shibata H., Hatta K., Maki M. (2004). CHMP4b is a major binding partner of the ALG-2-interacting protein Alix among the three CHMP4 isoforms. Arch. Biochem. Biophys. 421: 159—165. PMID 14678797 doi:10.1016/j.abb.2003.09.038
Usami Y., Popov S., Goettlinger H.G. (2007). Potent rescue of human immunodeficiency virus type 1 late domain mutants by ALIX/AIP1 depends on its CHMP4 binding site. J. Virol. 81: 6614—6622. PMID 17428861 doi:10.1128/JVI.00314-07