CDH6

CDH6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3LND
Ідентифікатори
Символи	CDH6, CAD6, KCAD, cadherin 6
Зовнішні ІД	OMIM: 603007 MGI: 107435 HomoloGene: 21027 GeneCards: CDH6
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • зв’язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • cell surface • catenin complex Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • адгезія клітин • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1004	12563
Ensembl	ENSG00000113361	ENSMUSG00000039385
UniProt	P55285	P97326
RefSeq (мРНК)	NM_004932 NM_001362435	NM_007666
RefSeq (білок)	NP_004923 NP_001349364	NP_031692
Локус (UCSC)	Хр. 5: 31.19 – 31.33 Mb	Хр. 15: 13.03 – 13.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH6 (англ. Cadherin 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 790 амінокислот, а молекулярна маса — 88 309.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRTYRYFLLL		FWVGQPYPTL		STPLSKRTSG		FPAKKRALEL		SGNSKNELNR
SKRSWMWNQF		FLLEEYTGSD		YQYVGKLHSD		QDRGDGSLKY		ILSGDGAGDL
FIINENTGDI		QATKRLDREE		KPVYILRAQA		INRRTGRPVE		PESEFIIKIH
DINDNEPIFT		KEVYTATVPE		MSDVGTFVVQ		VTATDADDPT		YGNSAKVVYS
ILQGQPYFSV		ESETGIIKTA		LLNMDRENRE		QYQVVIQAKD		MGGQMGGLSG
TTTVNITLTD		VNDNPPRFPQ		STYQFKTPES		SPPGTPIGRI		KASDADVGEN
AEIEYSITDG		EGLDMFDVIT		DQETQEGIIT		VKKLLDFEKK		KVYTLKVEAS
NPYVEPRFLY		LGPFKDSATV		RIVVEDVDEP		PVFSKLAYIL		QIREDAQINT
TIGSVTAQDP		DAARNPVKYS		VDRHTDMDRI		FNIDSGNGSI		FTSKLLDRET
LLWHNITVIA		TEINNPKQSS		RVPLYIKVLD		VNDNAPEFAE		FYETFVCEKA
KADQLIQTLH		AVDKDDPYSG		HQFSFSLAPE		AASGSNFTIQ		DNKDNTAGIL
TRKNGYNRHE		MSTYLLPVVI		SDNDYPVQSS		TGTVTVRVCA		CDHHGNMQSC
HAEALIHPTG		LSTGALVAIL		LCIVILLVTV		VLFAALRRQR		KKEPLIISKE
DIRDNIVSYN		DEGGGEEDTQ		AFDIGTLRNP		EAIEDNKLRR		DIVPEALFLP
RRTPTARDNT		DVRDFINQRL		KENDTDPTAP		PYDSLATYAY		EGTGSVADSL
SSLESVTTDA		DQDYDYLSDW		GPRFKKLADM		YGGVDSDKDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Shimoyama Y., Gotoh M., Terasaki T., Kitajima M., Hirohashi S. (1995). Isolation and sequence analysis of human cadherin-6 complementary DNA for the full coding sequence and its expression in human carcinoma cells. Cancer Res. 55: 2206—2211. PMID 7743525
• Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658

Див. також

• Хромосома 5