CAPN6

CAPN6
Ідентифікатори
Символи	CAPN6, CANPX, CAPNX, CalpM, DJ914P14.1, calpain 6, calpamodulin
Зовнішні ІД	OMIM: 300146 MGI: 1100850 HomoloGene: 7252 GeneCards: CAPN6
Онтологія гена Молекулярна функція • microtubule binding • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • веретено поділу • spindle microtubule • мікротрубочка • внутрішньоклітинний • цитоскелет • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of cytoskeleton organization • microtubule bundle formation • протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	827	12338
Ensembl	ENSG00000077274	ENSMUSG00000067276
UniProt	Q9Y6Q1	O35646
RefSeq (мРНК)	NM_014289	NM_007603
RefSeq (білок)	NP_055104	NP_031629
Локус (UCSC)	Хр. X: 111.25 – 111.27 Mb	Хр. X: 142.59 – 142.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CAPN6 (англ. Calpain 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 641 амінокислот, а молекулярна маса — 74 576.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGPPLKLFKN		QKYQELKQEC		IKDSRLFCDP		TFLPENDSLF		YNRLLPGKVV
WKRPQDICDD		PHLIVGNISN		HQLTQGRLGH		KPMVSAFSCL		AVQESHWTKT
IPNHKEQEWD		PQKTEKYAGI		FHFRFWHFGE		WTEVVIDDLL		PTINGDLVFS
FSTSMNEFWN		ALLEKAYAKL		LGCYEALDGL		TITDIIVDFT		GTLAETVDMQ
KGRYTELVEE		KYKLFGELYK		TFTKGGLICC		SIESPNQEEQ		EVETDWGLLK
GHTYTMTDIR		KIRLGERLVE		VFSAEKVYMV		RLRNPLGRQE		WSGPWSEISE
EWQQLTASDR		KNLGLVMSDD		GEFWMSLEDF		CRNFHKLNVC		RNVNNPIFGR
KELESVLGCW		TVDDDPLMNR		SGGCYNNRDT		FLQNPQYIFT		VPEDGHKVIM
SLQQKDLRTY		RRMGRPDNYI		IGFELFKVEM		NRKFRLHHLY		IQERAGTSTY
IDTRTVFLSK		YLKKGNYVLV		PTMFQHGRTS		EFLLRIFSEV		PVQLRELTLD
MPKMSCWNLA		RGYPKVVTQI		TVHSAEDLEK		KYANETVNPY		LVIKCGKEEV
RSPVQKNTVH		AIFDTQAIFY		RRTTDIPIIV		QVWNSRKFCD		QFLGQVTLDA
DPSDCRDLKS		LYLRKKGGPT		AKVKQGHISF		KVISSDDLTE		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

• Dear T.N., Matena K., Vingron M., Boehm T. (1997). A new subfamily of vertebrate calpains lacking a calmodulin-like domain: implications for calpain regulation and evolution. Genomics. 45: 175—184. PMID 9339374 doi:10.1006/geno.1997.4870
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома X