CADM1

CADM1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3BIN, 4H5S
Ідентифікатори
Символи	CADM1, BL2, IGSF4, IGSF4A, NECL2, Necl-2, RA175, ST17, SYNCAM, TSLC1, sTSLC-1, sgIGSF, synCAM1, cell adhesion molecule 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605686 MGI: 1889272 HomoloGene: 8641 GeneCards: CADM1
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• PDZ domain binding; • protein homodimerization activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • signaling receptor binding; • cell adhesion molecule binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • cell-cell junction; • синапс; • integral component of plasma membrane; • міжклітинні контакти; • basolateral plasma membrane; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• диференціація клітин; • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • activated T cell proliferation; • процес імунної системи; • multicellular organism development; • адгезія клітин; • Сперматогенез; • adherens junction organization; • T cell mediated cytotoxicity; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • GO:0097285 апоптоз; • susceptibility to natural killer cell mediated cytotoxicity; • positive regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity; • GO:0072466 detection of stimulus; • cell recognition; • GO:0022415 viral process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	23705
	54725
	ENSG00000182985
	ENSMUSG00000032076
	Q9BY67
	Q8R5M8
	NM_001098517; NM_001301043; NM_001301044; NM_001301045; NM_014333
	NM_001025600; NM_018770; NM_207675; NM_207676; NM_001310841
	NP_001091987; NP_001287972; NP_001287973; NP_001287974; NP_055148
	NP_001020771; NP_001297770; NP_061240; NP_997558; NP_997559
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CADM1 (англ. Cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 442 амінокислот, а молекулярна маса — 48 509^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASVVLPSGS	QCAAAAAAAA	PPGLRLRLLL	LLFSAAALIP	TGDGQNLFTK
DVTVIEGEVA	TISCQVNKSD	DSVIQLLNPN	RQTIYFRDFR	PLKDSRFQLL
NFSSSELKVS	LTNVSISDEG	RYFCQLYTDP	PQESYTTITV	LVPPRNLMID
IQKDTAVEGE	EIEVNCTAMA	SKPATTIRWF	KGNTELKGKS	EVEEWSDMYT
VTSQLMLKVH	KEDDGVPVIC	QVEHPAVTGN	LQTQRYLEVQ	YKPQVHIQMT
YPLQGLTREG	DALELTCEAI	GKPQPVMVTW	VRVDDEMPQH	AVLSGPNLFI
NNLNKTDNGT	YRCEASNIVG	KAHSDYMLYV	YDPPTTIPPP	TTTTTTTTTT
TTTILTIITD	SRAGEEGSIR	AVDHAVIGGV	VAVVVFAMLC	LLIILGRYFA
RHKGTYFTHE	AKGADDAADA	DTAIINAEGG	QNNSEEKKEY	FI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, клітинна адгезія, імунітет, диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Moiseeva E.P., Leyland M.L., Bradding P. (2012). CADM1 isoforms differentially regulate human mast cell survival and homotypic adhesion. Cell. Mol. Life Sci. 69: 2751—2764. PMID 22438059 doi:10.1007/s00018-012-0948-y
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Mao X., Seidlitz E., Truant R., Hitt M., Ghosh H.P. (2004). Re-expression of TSLC1 in a non-small-cell lung cancer cell line induces apoptosis and inhibits tumor growth. Oncogene. 23: 5632—5642. PMID 15184878 doi:10.1038/sj.onc.1207756
Boles K.S., Barchet W., Diacovo T., Cella M., Colonna M. (2005). The tumor suppressor TSLC1/NECL-2 triggers NK-cell and CD8+ T-cell responses through the cell-surface receptor CRTAM. Blood. 106: 779—786. PMID 15811952 doi:10.1182/blood-2005-02-0817
Mao X., Seidlitz E., Ghosh K., Murakami Y., Ghosh H.P. (2003). The cytoplasmic domain is critical to the tumor suppressor activity of TSLC1 in non-small cell lung cancer. Cancer Res. 63: 7979—7985. PMID 14633730

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CADM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5951 (англ.) . Архів оригіналу за 30 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-30 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9BY67 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CADM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5951 (англ.) . Архів оригіналу за 30 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-30 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q9BY67 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]